Проект – формат за анотация към учебна програма
|
|
|
- Евлоги Парушев
- преди 5 години
- Прегледи:
Препис
1 СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВЕТИ КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ БИОЛОГИЧЕСКИ ФАКУЛТЕТ СПЕЦИАЛНОСТ Генетика и Геномика АНОТАЦИЯ НА У Ч Е Б Н А П Р О Г Р А М А по Биоинформатика и Молекулна Еволюция Квалификационна степен Магистър Статут Задължителен Хорариум 60 (30+30) Кредити 7 Семестър 1 Форма на контрол Изпит Автор гл. ас. д-р Роберт Димитров Пенчовски, Катедра Генетика, Биологически Факултет АНОТАЦИЯ Описание на дисциплината Този курс подчертава еволюционните аспекти на биоинформатиката защото много от основните понятия в биоинформатиката, както търсене на сходство между ДНК, РНК и протеинови секвенции от различни видове, както и изграждане на филогенетични дървета, са тясно свързани с разбирането на молекулярната еволюция. Наличието на ДНК секвенции на цели геноми на много видове организми, предоставя на изследователите нови възможности за еволюционни изследвания. Биоинформатичната част от този курс обяснява използването на изчислителни методи в настоящата пост-геномна епоха за анализ на големи биологични бази данни включващи цели геноми, кодиращи и некодиращи РНКи, и протеини. Курсът обхваща и биоинформатични методи за анализ на индивидуални ДНК, РНК, и белтъчни молекули. Еволюционната част 1
2 от курса разглежда молекулярната еволюция на ниво ДНК, РНК и протеини последователности. Филогенетични методи са обхванати в подробности, както и примери за тяхното приложение при изследване на еволюцията. Курса представя в подробности различни методи за отриване на функционални части от генома базирани на анализ на молекулярна еволюция между различни видове организми. Освен това, особено място е обърнато на компютърно симулиране на молекулярна еволюция на функционални РНК молекули. В резултат от този курс у студентите ще се изграждат теоретични знания и практически умения за самостоятелен работа в областта на биоинформатиката и молекулярната еволюция, включително основни умения в използването на най-разпространения в биоинформатиката език за програмиране Perl. Литература 1. Higgs, P.G. & Attwood, T.K. Bioinformatics and Molecular Evolution, Blackwell Science Ltd., ISBN: (2005). 2. Tisdal, J. Beginning Perl for Bioinformatics. ISBN: (2001). 3. Gibas, C. & Jambeck P. Developing Bioinformatics Computer Skills. ISBN: (2001). 4. Xia, X. Bioinformatics and the Cell, Springer Science, ISBN-10: (2007). 5. Barnes, M.R. & Gray, I.C. Bioinformatics for Geneticists, ISBN: (2003). 6. Penchovsky, R. & Breaker, R.R. Computational design and experimental validation of oligonucleotide-sensing allosteric ribozymes. Nature Biotechnology, 23, (2005). 7. Penchovsky, R. & Ackermann, J. DNA library design for molecular computation. Journal of Computational Biology, 10, (2003). 2
3 Входни и изходни връзки. Курсът допълва и надгражда на знанията придобити по Генно и клетъчни инженерство и Синтетична биология и Геномика Структуриране на дисциплината Лекции 1. Въведение в биоинформатиката и молекулярна еволюция история, обхват, методи, връзки с други биологични науки - 2 часа 2. Бази данни за биоинформатика и молекулярна еволюция - 2 часа 3. Алгоритми за подравняване на секвенции - 2 часа 4. Методи за търсене в биоинформатични бази данни - BLAST and FASTA - 2 часа 5. Филогенетичен методи и молекулярната еволюция - 2 часа 6. Unix/Linux операционни системи и свободно достъпен софтуер за биоинформатика - 2 часа 7. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката - 2 часа 8. РНК биоинформатика - 2 часа 9. Модели на групи протеини - 2 часа 10. Намиране на гени и модели в биоинформатиката: вероятностни методи и машинно обучение - 2 часа 11. Aнализ на експериментални данни от ДНК микрочипове - 2 часа 12. Модели на молекулярна еволюция - 2 часа 13. Компютърно симулиране на еволюция на функционални РНКи - 2 часа 14. Биоинформатиката в пост-геномната ера. Второ поколение ДНК секвенатори и анализ на данни - 2 часа 15. Геномна еволюция - 2 часа 3
4 Упражнения 1. Инсталиране и запознаване със софтуерни програми и интернет бази данни, които ще се използват - 2 часа. 2. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 1-1 час. Основни команди на Linux/Unix и DOS - 1 час. 3. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 2-1 час. Търсене на секвенции с BLAST и FASTA - 1 час. 4. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 3-1 час. Основни формати на файлове в областта на биоинформатиката - 1 час. 5. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 4-1 час. CLC софтуер за ДНК анализ - 1 час. 6. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 5-1 час. Дизайн на ДНК праймери използвайки NCBI - 1 час. 7. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 6-1 час. Изграждане на филогенетични дървета - 1 час. 8. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 7-1 час. Анализ на вторични структури на РНК и тяхното значение за молекулярната еволяция - 1 час. 9. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 8-1 час. Търсене бази в база данни за некодиращи РНКи - 1 час. 10. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 9-1 час. Анализ на белтъчни последователности - 1 час. 11. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 10-1 час. Търсене в база данни за СНП-ми и наследствени болести у човека - 1 час. 12. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 11-1 час. Tърсене в протеинови база данни - 1 час. 4
5 13. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 12-1 час. Геномен анализ - 1 час 14. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 13-1 час. Моделиране на молекулярна еволюция - 1 час 15. Програмиране на Perl в областта на биоинформатиката, част 14-1 час. Компютърно симулиране на еволюцията на функционални РНК молекули - 1 час. Цели (и задачи) на дисциплината очаквани резултати от обучението Kурсът по Биоинформатика и Молекулярна Еволюция има за цел да запознае студентите със съвременните достижения на биоинформакиката и да изгради у тях както теоретични знания така и практически умения за боравене и анализ на огромното количество база данни достъпни в съвременната биология. Управление : 60 % задължителна посещаемост на лекции, като условие за допускане до изпит удостоверява се с подпис на лектора в студентската книжка 80 % задължителна посещаемост на упражнения Форма на контрол (изпит 80% и тест по време на упражнения 20% ) 5
Факултет ………………
П Л О В Д И В С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т ПАИСИЙ ХИЛЕНДАРСКИ България 4000 гр. Пловдив ул. ЦарАсен 24; Централа: (032) 261 261 Ректор: (032) 631 449 факс (032) 628 390 e-mail: rector@uni-plovdiv.bg Б И
П Л О В Д И В С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т ПАИСИЙ ХИЛЕНДАРСКИ България 4000 гр. Пловдив ул. ЦарАсен 24; Централа: (032) Ректор: (032) ф
П Л О В Д В С К У Н В Е Р С Т Е Т ПАСЙ ХЛЕНДАРСК България 4000 гр. Пловдив ул. ЦарАсен 24; Централа: (032) 261 261 Ректор: (032) 631 449 факс (032) 628 390 e-mail: rector@uni-plovdiv.bg Б О Л О Г Ч Е С
Биомедицинска Информатика
Биомедицинска Информатика ФМИ, СУ Св. Климент Охридски Магистърска програма o Специалност: Информатика o Ръководител: проф. д-р Евгений Кръстев o Катедра: Информационни Технологии o Имейл : eck@fmi.uni-sofia.bg
СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ СТОПАНСКИ ФАКУЛТЕТ У Ч Е Б Е Н П Л А Н Утвърждавам:... Утвърден от Академически съвет с протокол... /... Про
СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ СТОПАНСКИ ФАКУЛТЕТ У Ч Е Б Е Н П Л А Н Утвърждавам:... Утвърден от Академически съвет с протокол... /... Професионално направление: 3.7. Администрация и управление
ТЕХНИЧЕСКИ УНИВЕРСИТЕТ СОФИЯ УТВЪРЖДАВАМ Ректор: /проф. д-р инж. М. Христов/ Срок на обучение: Форма на обучение: 4 години редовна У Ч Е Б Е Н П Л А Н
ТЕХНИЧЕСКИ УНИВЕРСИТЕТ СОФИЯ УТВЪРЖДАВАМ Ректор: /проф. д-р инж. М. Христов/ Срок на обучение: Форма на обучение: 4 години редовна У Ч Е Б Е Н П Л А Н за образователно-квалификационна степен бакалавър
(Microsoft Word - \ doc)
Утвърдил:.. Декан Дата... СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ Факултет: Философски Специалност: (код и наименование) Ф Ф П 3 6 0 1 1 Организационно поведение и консултиране на организацията Дисциплина:
СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ СТОПАНСКИ ФАКУЛТЕТ У Ч Е Б Е Н П Л А Н Утвърждавам:... Утвърден от Академически съвет с протокол... /... Про
СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ СТОПАНСКИ ФАКУЛТЕТ У Ч Е Б Е Н П Л А Н Утвърждавам:... Утвърден от Академически съвет с протокол... /... Професионално направление: 3.7. Администрация и управление
ЦЕНТЪР ПО ИНФОРМАТИКА И ТЕХНИЧЕСКИ НАУКИ УЧЕБНА ПРОГРАМА Утвърждавам: Декан: CS 206 ИЗКУСТВЕН ИНТЕЛЕКТ Приета: прот. 8 от г.; Актуализирана
ЦЕНТЪР ПО ИНФОРМАТИКА И ТЕХНИЧЕСКИ НАУКИ УЧЕБНА ПРОГРАМА Утвърждавам: Декан: CS 206 ИЗКУСТВЕН ИНТЕЛЕКТ Приета: прот. 8 от 28.04.2005 г.; Актуализирана прот. 16 от 17.06.2016 г. Лектор: Акад. Проф. Иван
Microsoft Word - UchPlan_Logistika_17_03_11_ikonomisti
СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ УЧЕБЕН ПЛАН Утвърждавам, (подпис) Професионално направление: 3.8. Икономика Специалност: Икономика Магистърска програма: Икономика и управление на логистиката
Microsoft Word - plan_mag_red_5s_MEIT.doc
С О Ф И Й С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т СВ. К Л И М Е Н Т О Х Р И Д С К И УЧЕБЕН ПЛАН Утвърждавам, Професионално направление: ФИЗИЧНИ НАУКИ 4.1. Образователно- квалификационна... (подпис) степен: магистър
mm
С О Ф И Й С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т СВ. К Л И М Е Н Т О Х Р И Д С К И УЧЕБЕН ПЛАН Утвърждавам, Професионално направление: ФИЗИЧЕСКИ НАУКИ 4.1 Образователно- квалификационна... (подпис) степен: МАГИСТЪР
Microsoft Word - UchPlan_IUEIKU_3_za_1_kurs
СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ УЧЕБЕН ПЛАН Утвърждавам, (подпис) Професионално направление: 3.8. Икономика Специалност: Икономика Магистърска програма: Икономика и управление в енергетиката,
Факултет ………………
Факултет ПЛОВДИВСКИ УНИВЕРСИТЕТ «ПАИСИЙ ХИЛЕНДАРСКИ» Биологически Професионално направление 4.3. Биологически науки Специалност Биология Форма на обучение Редовно Утвърден с протокол на АС 35 / 14.07.2014
Microsoft Word - MEIT_Valcheva_Analit metodi.doc
Утвърдил:.. Декан Дата... СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ Факултет: Физически Специалност: (код и наименование) Магистърска програма: (код и наименование) Микроелектроника и Информационни технологии
Проф
Утвърдил:.. Декан Дата... СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ Факултет: Геолого-Географски Специалност: (код и наименование) Г Г А 0 1 0 1 1 7 Регионално развитие и политика Магистърска програма:
ФЗ Ф код на спец. код на дисциплина та Специалност "ФИЗИКА" / магистърска програма "ТЕРМОЯДРЕН СИНТЕЗ И ПЛАЗМЕНИ ТЕХНОЛОГИИ" Наименование на
Ф Ф 35 21 16 код на спец. код на дисциплина та Специалност "ФКА" / магистърска програма "ТЕРМОЯДРЕН СНТЕ ПЛАМЕН ТЕХНОЛОГ" Наименование на учебната дисциплината за випуска, започнал през 2016 / 2017 учебна
Microsoft Word - MEIT_Burova-BD.doc
Утвърдил:.. Декан Дата... СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ Факултет: Физически... Специалност: (код и наименование)... Магистърска програма: Микроелектроника и информационни технологии Дисциплина:
разпис. за уч. занятия ЕООС-17-18г-зима
Време (часове) СЕДМИЧНО РАЗПИСАНИЕ НА СПЕЦИАЛНОСТ БООС и БУПР БУПР І КУРС Понеделник Вторник Сряда Четвъртък Петък 7,15-8,00 8,15-9,00 9,15-10,00 Обща и неорганична химия лаб. упр.- 406 зала ас. д-р К.Тодорова
ИЗБИРАЕМИ ДИСЦИПЛИНИ ЗА ЗИМЕН СЕМЕСТЪР Г. СПЕЦИАЛНОСТ "УНГАРСКА ФИЛОЛОГИЯ" Пояснeния: 1) Подробна информация за технологията за записване пр
ИЗБИРАЕМИ ДИСЦИПЛИНИ ЗА ЗИМЕН СЕМЕСТЪР 06-07 Г. СПЕЦИАЛНОСТ "УНГАРСКА ФИЛОЛОГИЯ" Пояснeния: ) Подробна информация за технологията за записване през СУСИ е публикувана в Указания за записване на избираеми
Microsoft Word - kstB_kr.doc
Учебен план съгласно ЕСТК FTE фундаментални дисциплини; TBE T тип на образователно-квалификационната степен: B - бакалаври, M - магистри ; CS - Компютърни системи и технологии ; пореден номер на дисциплината;
СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ ФАКУЛТЕТ : Стопански У Ч Е Б Е Н П Л А Н Утвърждавам:... Утвърден от Академически съвет с протокол... /... П
СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ ФАКУЛТЕТ : Стопански У Ч Е Б Е Н П Л А Н Утвърждавам:... Утвърден от Академически съвет с протокол... /... Професионално направление: 3.8 Икономика ОКС магистър
Microsoft Word - UchPlan_IkUprObrazovanie_5_za_1_kurs
СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ. КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ УЧЕБЕН ПЛАН Утвърждавам, (подпис) Професионално направление: 3.8 Икономика Образователно-квалификационна степен: Магистър Специалност: Икономика Срок на обучение:
АКАДЕМИЧЕН СТАНДАРТ ЗА УЧЕБНА ДИСЦИПЛИНА ОСНОВИ НА ОБРАЗНАТА ДИАГНОСТИКА. РЕНТЕНОГРАФСКИ МЕТОДИ 1. Цел на обучението по дисциплината Целта на обучение
АКАДЕМИЧЕН СТАНДАРТ ЗА УЧЕБНА ДИСЦИПЛИНА ОСНОВИ НА ОБРАЗНАТА ДИАГНОСТИКА. РЕНТЕНОГРАФСКИ МЕТОДИ 1. Цел на обучението по дисциплината Целта на обучението по дисциплината е огласено в раздел Анотация в учебната
Факултет ………………
ПЛОВДИВСКИ УНИВЕРСИТЕТ «ПАИСИЙ ХИЛЕНДАРСКИ» Факултет Биологически Професионално направление 4.3. Биологически науки Специалност Екология на биотехнологичните производства Форма на обучение Редовно Утвърден
И К О Н О М И Ч Е С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т В А Р Н А С Т О П А Н С К И Ф А К У Л Т Е Т КАТЕДРА ИКОНОМИКА И УПРАВЛЕНИЕ НА ТЪРГОВИЯТА УТВЪРЖДАВАМ: Ре
И К О Н О М И Ч Е С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т В А Р Н А С Т О П А Н С К И Ф А К У Л Т Е Т КАТЕДРА ИКОНОМИКА И УПРАВЛЕНИЕ НА ТЪРГОВИЯТА УТВЪРЖДАВАМ: Ректор: (Проф. д-р Пл. Илиев) У Ч Е Б Н А П Р О Г Р А
Мехатроника
ТЕХНИЧЕСКИ УНИВЕРСИТЕТ СОФИЯ Утвърждавам РЕКТОР: (проф.дтн. инж. Георги Михов) Дата:. год. Образователно-квалификационна степен: Професионална квалификация: Срок на обучение: Форма на обучение: Магистър
Microsoft Word - imB_kr
ТЕХНИЧЕСКИ УНИВЕРСИТЕТ - СОФИЯ ФИЛИАЛ ПЛОВДИВ Утвърждавам, Ректор: /п/ (проф. д-р инж. К. Веселинов) Дата : 10.12.2008 г. УЧЕБЕН ПЛАН на специалността ИНДУСТРИАЛЕН МЕНИДЖМЪНТ Професионално направление:
Microsoft Word - Ucheben plan_HimiaiFizika_bachelor.doc
С О Ф И Й С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т СВ. К Л И М Е Н Т О Х Р И Д С К И УЧЕБЕН ПЛАН Утвърждавам, Професионално направление: ПЕДАГОГИКА НА ОБУЧЕНИЕТО ПО (подпис) Специалност: ХИМИЯ И ФИЗИКА Образователно-
A9R1oc1x9e_lla9tw_82c.tmp
2 СОФИЙСКИ УНИВЕРСИТЕТ СВ КЛИМЕНТ ОХРИДСКИ СТОПАНСКИ ФАКУЛТЕТ У Ч Е Б Е Н П Л А Н Утвърждавам: Утвърден от Академически съвет с протокол / Професионално направление: 38 Икономика ОКС магистър Специалност:
Експорт към MS Word
E24: Лекции, спец.курсове, упражнения и семинари, водени от служители на звеното Звено: ( ИМикБ ) Институт по Стефан Ангелов Година: 2018 2018 Тип записи: Записи, които влизат в отчета на звеното Тип обучителна
АМГ - учебен план бакалаври
С О Ф И Й С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т СВ. К Л И М Е Н Т О Х Р И Д С К И УЧЕБЕН ПЛАН (корекции до 1.07.011) Утвърждавам, Професионално направление: 4.1. ФИЗИКА... Образователно- квалификационна (подпис)...
Вид на учебните дисциплини- З, И, Ф Изпити Текущи оценки ECTS- кредити Всичко задължителни занятия Лекции Семинарни занятия Практически упражнения С О
Вид на учебните дисциплини- З, И, Ф Изпити Текущи оценки ECTS- кредити Всичко задължителни занятия Лекции Семинарни занятия Практически упражнения С О Ф И Й С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т СВ. К Л И М Е Н
ПЛОВДИВСКИ УНИВЕРСИТЕТ ПАИСИЙ ХИЛЕНДАРСКИ БИОЛОГИЧЕСКИ ФАКУЛТЕТ Пловдив 4000, ул. Цар Асен 24, тел./факс: , е-mail:
ПЛОВДИВСКИ УНИВЕРСИТЕТ ПАИСИЙ ХИЛЕНДАРСКИ БИОЛОГИЧЕСКИ ФАКУЛТЕТ Пловдив 4000, ул. Цар Асен 24, тел./факс: 032 261 566, е-mail: biosecr@uni-plovdiv.bg;g ФАКУЛТЕТНА КОМИСИЯ ПО КАЧЕСТВОТО РЕЗУЛТАТИ И АНАЛИЗ
Учебен план (пример)
П Л О В Д И В С К И У Н И В Е Р С И Т Е Т ПАИСИЙ ХИЛЕНДАРСКИ България 4000 гр. Пловдив ул. Цар Асен 24; Централа: (032) 261 261 Ректор: (032) 631 449 факс (032) 628 390 e-mail: rector@uni-plovdiv.bg Ф
№
ТЕХНИЧEСКИ УНИВЕРСИТЕТ СОФИЯ УТВЪРЖДАВАМ РЕКТОР: (проф. д-р М. Христов) Дата: Образователно-квалификационна степен: Професионална квалификация: Бакалавър Машинен инженер Срок на обучение: Форма на обучение:
ЦЕНТЪР ПО ИНФОРМАТИКА И ТЕХНИЧЕСКИ НАУКИ УЧЕБНА ПРОГРАМА Утвърждавам: Декан EN372 ЕЛЕКТРОСНАБДЯВАНЕ Актуализирана : Протокол.16 от г. лекто
ЦЕНТЪР ПО ИНФОРМАТИКА И ТЕХНИЧЕСКИ НАУКИ УЧЕБНА ПРОГРАМА Утвърждавам: Декан EN372 ЕЛЕКТРОСНАБДЯВАНЕ Актуализирана : Протокол.16 от 17.06.2016 г. лектор д-р Гинко Георгиев АНОТАЦИЯ Курсът Електроснабдяване