Становище

Препис

1 Становище от проф. д-р Венета Иванова Грудева, Софийски университет Св. Кл. Охридски, Биологически факултет по конкурс за доцент по 4.3 Биологически науки (Обща и приложна микробиология и микробна биоинформатика), обявен в ДВ бр. 47/ за нуждите на Биологически факултет при СУ Св. Кл. Охридски катедра по Обща и приложна микробиология По обявеният конкурс се явява единствен кандидат гл. ас. д-р Венцислава Янкова Петрова 1. Кратки биографични данни за кандидата Гл. ас. д-р Венцислава Янкова Петрова е единствен кандидат по обявеният конкурс за доцент. Представените документи за участие в конкурса от кандидатката са изготвени много прецизно, съгласно изискванията. Венцислава Петрова е родена през 1974 г. в гр. София. През 1997 г.завършва магистърска степен по Молекулярна биология (Микробиология) в Биологически Факултет на СУ. През 1988 г завършва Европейска магистърска степен по Биотехнология по Проект ТЕМПУС на СУ- Биологически Факултет. В периода г.работи като еспециалист- микробиолог в Биологически Ф-т. Пред 2000 г. е зачиследна на редовна докторантура и придобива докторска степен по Клетъчна Биология през 2004 г. От 2004 г до настоящия момент е главен асистент по микробиология в катедрата по Обща и промишлена микробиология на Биологически Факултет. За посоченият период д-р Петрова е повишила научната и преподавателската си квалификация чрез различни краткосрочни и дългосрочни специализации във водещи европейски Университети катоуниверситета на Нант, Франция една тримесечна и една 10 месечна специализация; Университета в Сарбрюкен, Германия 6 месеца, няколко краткосрочни специализации във Франция, Италия, Германия. Била е гост преподавател по Биоинформатика в Университета в Страсбург, Франция. 2. Характеристика на учебно-преподавателската дейност на кандидата 2.1. Аудиторна и извънаудиторна дейност Д-р Петрова има 10 години трудов стаж като гл. асистент в катедрата по Обща и промишлена микробиология. За този период тя има значителна учебна натовареност ежегодно значително над норматива. Води практически занятия по микробиология в бакалавърските степени по Молекулярна биология и Биотехнологии, по Приложна микробиология както и практически занятия в няколко задължителни и изборни курсове в магистърската програма по Микробиология и микробиологичен контрол като Биоинформационни методи в микробиологията, Устойчивост към индустриален стрес при дрожди, Голям практикум по култивиране на микроорганизми, Санитарна микробиология, Антибиотици. Има и сериозни ангажименти в стартиралата през настоящата учена година магистърска програма по Качество и контрол на храни. От 2012 г. са и възложени лекции по микробиология в бакалавърска степен по Биология, Приложна микробиология както и лекции в няколко изборни курсове от магистърските програми. През годините и в момента, учебната натовареност на д-р Петрова се характеризира както с огромен обем, така и с голямо разнообразие, което говори за нейните широки интереси. Пред последните години интензивно развива ново

2 направление в катедрата по биоинформатичен анализ, което се посреща с интерес от студентите магистри. Д-р Петрова се характеризира като взискателен, ерудиран преподавател, системен в работата си Учебни материали Гл. ас. Д-р Петрова е участвала като съавтор при изготвянето на 4 учебни програми по Биоинформационни методи в микробиологията (в ОКС магистър ), Приложна микробиология (в ОКС магистър ), Санитарна Микробиология (в ОКС магистър ), Получаване на щамове-свръх продуценти (в ОКС бакалавър ), Микробиология (в ОКС бакалавър ). Като участник в международни обучителни проекти д-р Петрова е съавтор на 6 учебни помагала в различни направления на микробиологията. Това е сериозен принос, тъй като тези учебни помагала са на английски език и практически катедрата е готова за обучение на английски, което е една от сериозните задачи на СУ и респективно БФ Работа със студенти За периода от назначаването и за гл. асистент до настоящия момент д-р Петрова работи активно със студенти бакалаври и магистри и под нейно ръководство успешно са защитили 8 дипломанти от магистърската степен по микробиология и микробиологичен контрол 3. Научно-изследователска дейност 3.1. Обща характеристика на научните трудове Д-р Петрова има общо 25 публикации (3 броя публикации са от периода преди придобиване на ОНС доктор, както и автореферат). За участие в настоящия конкурс са представени 22 научни труда, от които 19 са публикувани в реферирани и идексирани научни списания и такива с импакт фактор и 3 броя в сборници от международни конференции. Импакт факторът на публикациите, представени за участие в конкурса е В над 80 % от публикациите тя е първи или втори съавтор. От приложената справка в документите е видно, че трудовете на кандидтката са цитирани 142 пъти в реферирани списани и други цитирания h- индексът на кандидатката е 6. Представен е и списък на 22 участия в национални и международни научни форуми. По наукометрични показатели д-р Петрова отговаря напълно на изискванията за заемане на академичната длъжност доцент Характеристика на научната дейност на кандидата Представените трудове на кандидата са в научната област на конкурса и са обобщени в трите основни направления на конкурса, а именно: обща микробиология, приложна микробиология и микробна биоинформатика. Изследванията на кандидатката са свързани с изучаване на различни аспекти на биологията на еукариотни микроорганизми с различен таксономичен статус. Значителна част от тях са свързани изучаване на клетъчните и молекулни механизми на стресов отговор при гъби (Публикации I-12A-2-2-2, I-12A-2-2-4, I-12A и I-12A ). Изследвана е промяната в клетъчния растеж и структура при модулиране на условията на култивиране (източник на въглерод: глюкоза, етанол, метанол, глицерол), както и при въздействие с различни стресови фактори (Н2О2, паракват, менадион, Cd2+). Охарактеризиран е клетъчният растеж и динамиката на органелна биогенеза при различни по своя метаболизъм дрожди. Оценен е ефектът на въздействие на различни индуктори на оксидативен стрес (Н2О2, паракват, менадион) върху растежа на 2

3 дрождеви микроорганизми с ферментативен, респираторен и облигатно оксидативен тип на метаболизъм. Изследван е in vivo токсичният ефект на различни концентрации на Cd 2+ при 7 метаболитно различни видове дрожди и е установена повишена устойчивост към тежки метали и запазване на жизнеспособност в присъствието на високи концентрации на Cd(NO3)2 (1.5 mm) при два вида от тях. Изучен е балансираният растеж на дрождите при периодично култивиране в присъствието на различни въглеродни източници глюкоза, етанол, метанол и глицерол. Определена е връзката между условията на култивиране, кинетичните параметри на растеж (µ и Yx/s) и механизмите на стресов отговор при дрожди, характеризиращи се с различен тип на метаболизъм. Ролята на въглеродния метаболизъм в метаболитната адаптация и поддържането на клетъчната редокс-хомеостаза при дрожди е обект на сериозно изследване (Публикации I-12A-2-2-2, I-12A-2-2-4, I-12A и I-12A ) Проследени са на специфичните активности на ключови ензими от антиоксидантната защитна система СОД и каталаза. Установена е връзката между условията на култивиране, динамиката на клетъчен растеж и регулацията на генната експресия на СОД и каталаза при дрожди с различен тип на метаболизъм. Охарактеризирани са електрофоретичните профили на ключовите антиоксидантни ензими СОД и каталаза при пет вида дрожди (S. cerevisiae, K. marxianus, P. pini, H. polymorpha и R. glutinis) и са установени еволюционните и метаболитни връзки между тях. За първи път е доказано, че в условия на повишена концентрация на ROS в клетките на метилотрофни дрожди от родовете Pichia и Hansenula се експресират допълнителни мултимерни форми на Mn СОД. Получени са оригинални доказателства за висока термостабилност и слабата устойчивост на редуциращи агенти на СОД ензимите при метилотрофни дрожди от родовете Pichia и Hansenula. Изучена е динамиката на ензимната компартментализация (Публикации I-12A и I-12A-2-2-9) при обезвреждането на активните кислородни видове в клетката от ензимите супероксид дисмутаза (СОД) и каталаза, чието кооперативно действие осигурява незабавното обезвреждане на ROS на мястото на тяхното възникване. За първи път е доказана възможност за двойно насочване на пероксизомалната каталаза и Mn СОД при метаболитно различни типове дрожди (факултативно ферментативни и обигатно окидативни) в два типа органели - пероксизоми и митохондрии, където тези ензими играят ключова роля при поддържане на редокс хомеостазата. Установено е, че промяната в клетъчния метаболизъм води до изменение в насочването на каталазния и Mn СОД ензим към пероксизоми и митохондрии. Изследвана е и ролята на глутатиона като основен фактор на неензимната клетъчна защита от стрес при дрожди и ролята на Ure2p белтъка в азотния метаболизъм и антиоксидантния клетъчен отговор. (Публикации I-12A-2-2-6). Установено е, че URE2 мутация води до намаляване на вътреклетъчната концентрация на глутатион и клетките се характеризират с нарушен антиоксидантен баланс и повишена белтъчна деградация. Част от публикациите на кандидата са свързани с изучаване на връзката между структура и функция при Cu/Zn СОД от дрожди Kluyveromyces marxianus: ключов биомаркер на оксидативния стрес (Публикации I-12A-2-2-5, I-12A и I-12A ) Разработена е бърза, високо специфична и ефективна тристепенна процедура за получаване на пречистен Cu/Zn СОД ензим от дрожди от вида Kluyveromyces marxianus. Установени са специфичните структурни характеристики на Cu/Zn СОД белтък, дължащи се на неговата гликопротеинова природа. В направлението приложна микробиология изследванията на кандидатката са също в няколко направления. Едно от тях е свързано с изследване на генетичния 3

4 контрол на индустриални ферментациии (Публикации I-12A и I-12A-2-2-7). Разработена е опростена процедура за генетичен контрол на индустриални ферментации на дрожди, основаваща се на mtdna-rflp анализ. Чрез този метод може достоверно да се оценява влиянието на различни стресови фактори на средата върху генетичната стабилност на микробните популации. Сериозни изследвания са проведени с термотолерантни лактозоусвояващи дрожди от р. Kluyveromuces продуценти на D-аминооксидаза и β-галактозидаза, α кетокиселини, β-галактоолигозахариди, хранителни добавки и ароматни вещества. Селекционирани са щамове дрожди с потенциал за използуване в различни биотехнологични производства. Биосинтеза, получаване и свойства на пигментни препарати от гъби, принадлежащи към р. Monascus са също обект на изследване от кандидатката. Регистриран е щам Monascus pilosus C1 Cit- като продуцент на биомаса, пигменти и биоактивни продукти. Изследвания върху биосинтезата и експресия на D-аминооксидаза, СОД, каталаза и β-галактозидаза, и получаване на α-кето киселини и галактоолигозахариди са отразени в няколко от публикациите (Публикации I-12A-2-2-3, I-12A и патент I- 12D-1). Чрез оптимизиране на условията за култивиране, пермеабилизиране и имобилизиране с глутар-алдехид е постигната свръх-експресия на D-аминооксидаза, СОД, каталаза и β-галактозидаза. Разработен е оригинален метод за получаване на D- аминооксидаза и съпътстващи ензими (СОД, каталаза и β-галактозидаза) от щам K. marxianus NBIMCC No 8362, защитен с патент Сериозни изследвания са извършени и по селекция на дрожди с пробиотичен ефект. Въз основа на проведените изследвания е получен пробиотичен препарат, представляващ суха биомаса/дезинтеграт от дрождеви щам Kluyveromyces marxianus 903, с повишено съдържание на белтък (45,5 %), есенциални аминокиселини (68 % от тоталния белтък) и витамини (0,046 %).Разработен е метод за получаване на пробиотичен препарат описан в патентна заявка Пробиотичен препарат ЛАКТОСЕЛ 2745/ Направлението по микробна биониформатика д-р Петрова развива интензивно в последните няколко години. (Публикации I-12A-2-2-9, I-12A , I-12A , I- 12A , I-12A и I-12A ). Изследванията са свързани осъществяване на in silco анализ на гени, отговорни за антиоксидантната защитна система при дрожди от вида Saccharomyces cerevisiae. Кандидатката установява, че дупликацията на гените и появата на алтернативни метаболитни пътища са основни еволюционни механизми за адаптация на клетките и поддържане на клетъчния интегритет. За устойчивостта и гъвкавостта на ензимната антиоксидантна защитна система при дрожди от р. Saccharomyces, еволюционно преимуществено се постига чрез поява на алтернативни метаболитни пътища. С помощта на биоинформатични методи e проследена локализацията на Cu/Zn и Mn СОД при дрожди S. cerevisiae. Със същият тип методи са изследвани различни видове дрожди и са проучени механизмите за стресов отговор и придобиване на резистентност към токсични тежки метали - Cd 2+. Установено е, че видовете S. pombe и C. glabrata са устойчиви на високи концентрации на Cd 2+, като за първи път подобни характеристики са установени и при видовете H. polymorpha и R. graminis. Чрез сравнителния in silico анализ на ключови антиоксидантни ензими е доказано, че резистентността към този токсичен метал се дължи на генетично детерминирани особености на изследваните дрождеви микроорганизми. Доказана е висока еволюционна консервативност по отношение брой ортолози, кодиращи ензими от глутатионовия метаболизъм. Установена е и дивергенция в генната хомология и вътреклетъчна локализация. Тези фактори обуславят висока 4

5 клетъчна метаболитна пластичност и адаптивност на изследваните видове дрожди към различни стресови въздействия. Избрани щамове, принадлежащи към два вида Monascus (Monascus pilosus и Monascus purpureus) и са използвани за изучаване на генетичните особености и експресионните профили на антиоксидантните ензими СОД и каталаза. Прилагането на компютърни подходи позволява идентифицирането на множество СОД и каталазни паралози в изследваните видове от род Monascus. Разработен е подход за съвместно използване на биохимични и компютърни данни при еволюционен анализ на ключови за клетката гени и е доказано, че видовете принадлежащи към р. Monascus притежават няколко монофункционални СОД и каталазни ензими, експресиращи се асоциирано с растежа на клетката и в отговор на излагане на различни стресови въздействия. Анализът на научната дейност на д-р Петрова и получените резултати ясно показват, че това е изграден учен с отлична осведоменост в областта на микробиологията, молекулярната биология и биоинформатиката. Получените резултати имат съществени научни приноси. Освен това фундаменталните резултати са намерили отлична практическа реализация, което считам като сериозно достойнство на работата на кандидатката. 4. Проектна и патентна дейност Д-р Петрова има завидна проектна дейност. От постъпването си в Билогически факултет до настоящия момент тя е участвувала в 23 проекти научни и обучителни и е била ръководител на два проекта. Посочените проекти са предимно международни. Това й създава умения за успешно решаване на организационни и логистични проблеми, целенасочено проследяване на поставените задачи, изготвяне на планове за действие, организиране на срещи, семинари. Д-р Петрова е съавтор на един патент и две патентни заявки 6. Организационна и административна ангажираност Д-р Петрова участва активно в организационния живот на катедрата по Обща и промишлена микробиология. Била е секретар на катедрата, понастоящем е отговорник по учебната работа. Отговорник е по надзора и безопасността на ГМО към катедрата. Член е на няколко комисии на БФ КУТ, Учебна комисия, Член на Съвета на специалностите за Молулярна биология. Активно работи за популяризирането на учебната и научната дейност на екипа, в който работи и катедрата като цяло. Това допринася съществено за интереса към магистърските и докторските програми на катедрата 7. Награди и отличия За своята изследователска дейност д-р Петрова е отличена с три награди научна награда за Най-добра научна работа на млад микробиолог от страната на Фондация Стефан Ангелов, Грамота за научни постижения от съюза на Учените в България, Награда за професионални и научни постижения на млад учен от СУ. 8. Лични впечатления от кандидата Познавам д-р Петрова от студентските й години когато съм й била преподавател. Свидетел съм на нейното стремително успешно израстване като преподавател и учен. В продължение на години тя е била асистент по микробиология в курсовете, на които съм титуляр. Сериозен, отлично подготвен преподавател, взискателен и последователен в работата си. Перспективен изследовател, специалист с висока квалификация в съвременните направления на микробиологията, специалист с богат организацзионен опит, умения за работа в екип, управление на проекти и популяризиране на достиженията им. В лицето на д-р Петрова катедрата ще има отлично подготвен доцент с доказани възможности за високо качество на обучение и съвременни научни изследвания. 5

6 9. Заключене Гл. ас. д-р Венцислава Петрова има учебна заетост и научна продукция, които отговарят напълно на изискванията за заемане на академичната длъжност доцент. Учебната й дейност се отличава с последователност и високо качество. Работата й със студентите е свързана с инициативност, стремеж за издигане на нивото на обучение, създаване на интерес в студентите към биологията и в частност микробиологията, изтраждане у тях на умения за работа в екип и последователност в бъдещата им реализация. Тя е търсена от студентите като научен ръководител на дипломни работи, за което говори сериозната и ежегодна ангажираност с този вид дейност. Резултатите от нейната научна дейност имат сериозни научни, приложни и методични приноси, за което говорят знаячителния брой цитирания на нейните научни трудове. Значителният брой проекти в които тя участвува като член на колектив или е ръководител дават основание да се счита, че тя е отличен изследовател, притежава умения за работа в екип както и да бъде ръководител на такъв. Считам, че за времето, прекарано в Биологически Факултет, който впрочем е и единственото й работно място, д-р Петрова е работила и продължава да работи изключително всеодайно в учебната, изследователската и административната дейност. На базата на Правилника за приложение на закона за развитие на академичния състав в РБългария, Правилника за условията и реда за придобиване на научни степени и заемане на академични длъжности на СУ Св. Кл. Охридски и допълнителните критерии на Биологически факултет, както и въз основа на всичко посочено по- горе, считам, че гл. ас. д-р Венцислава Петрова притежава всички качества и отговаря напълно на изискванията за заемане на академичната длъжност доцент по 4.3. Биологически науки (Обща и приложна микробиология и микробна биоинформатика) Убедено предлагам на уважаемите членове на научното жури единодушно да й присъдят тази длъжност год. Подпис: (проф. д-р Венета Грудева) 6