Microsoft Word - recenzia_Petrova_Moncheva.doc

Препис

1 Р Е Ц Е Н З И Я от проф. Пенка Ангелова Мончева, д-р, Софийски университет Св. Кл. Охридски, Биологически факултет, член на научно жури, назначено със заповед РД / на Ректора на СУ по конкурс за доцент по 4.3 Биологически науки (Обща и приложна микробиология и микробна биоинформатика), обявен в ДВ бр. 47/ г за нуждите на Биологически факултет при СУ Св. Кл. Охридски катедра «Обща и промишлена микробиология» кандидат по конкурса: гл. ас. д-р Венцислава Янкова Петрова 1. Кратки биографични данни за кандидата Единствен кандидат в конкурса за заемане на академичната длъжност доцент по 4.3 Биологически науки (Обща и приложна микробиология и микробна биоинформатика), обявен от СУ Св. Кл. Охридски за нуждите на катедра Обща и промишлена микробиология е гл ас. д-р Венцислава Янкова Петрова. Предоставената от кандидата документация по този конкурс е подготвена перфектно и съдържа всичко необходимо, съгласно изискванията на законовите норми. Това дава възможност за придобиване на пълно впечатление от дейността на кандидата във всичките й компоненти, което е необходимо за обективното й оценяване. Д-р Петрова е родена през 1974 г в София. През 1997 г завършва висшето си образование в специалност Молекулярна биология и се дипломира като магистър-микробиолог в Биологически факултет на СУ Св. Кл. Охридски. През 1998 г тя придобива Европейска магистърска степен по Биотехнология по програма ТЕМПУС. От 1998 до 2000 г работи като специалист-микробиолог по програма ТЕМПУС в Катедрата по Обща и промишлена микробиология към Биологически факултет. В периода г. е редовен докторант по Клетъчна биология, като придобива образователната и научна степен доктор през 2004 г. От 2004 г до момента тя е последователно асистент и главен асистент, в катедрата по Обща и промишлена микробиология. 2. Характеристика на учебно-преподавателската дейност на кандидата 2.1. Аудиторна и извънаудиторна дейност Д-р Петрова има над 10 години преподавателски стаж, който стартира още когато тя е редовен докторант, когато със заповед на Ректора на СУ е й възлагано извеждането на практически занятия. Ежегодната й учебна натовареност за периода, от който тя е избрана за асистент и впоследствие гл. асистент и до момента е минимум 360 часа (аудиторна заетост), което е сериозна преподавателска ангажираност. В началото на своята кариера като преподавател тя е водила главно практически занятия, но по-късно са й възлагани и лекции. Тя е извеждала и извежда практически занятия както в ОКС бакалавър, така и в ОКС магистър. В ОКС бакалавър тя води упражнения по Микробиология за специалност Молекулярна биология и Методи за получаване на щамовесвръхпродуценти (спец. Биотехнологии) и в ОКС магистър (магистърска програма 1

2 Микробиология и микробиологичен контрол ) по Приложна микробиология, Биоинформационни методи в микробиологията и Устойчивост към индустриален стрес при дрождеви микрооганизми. От 2010 г тя извежда част от лекционния курс по Методи за получаване на щамове свръхпродуценти за студенти от ОКС бакалавър, специалност Биотехнологии, а от 2015 г част от лекционния курс по Микробиология с вирусология в същата степен за студенти от специалност Биология и курсът по Приложна микробиология в магистърска програма Микробиология и микробиологичен контрол. Тя е титуляр на курса по Обща и почвена микробиология за студенти от бакалавърска специалност Агробиотехнологии, която стартира от 2016 г. В продължение на много години тя е извеждала и част от лятната учебна практика по Микробиология в ОКС бакалавър, специалност Молекулярна биология. Учебната заетост на д-р Петрова се характеризира не само със сериозен обем, но и с разнообразие, което е израз на нейните широки интереси в тази част от нейната академична дейност. Като колега на д-р Петрова, а и като дългогодишен ръководител на катедрата по Обща и промишлена микробиология съм имала непосредствен поглед върху нейната преподавателска дейност. Тя е оставила в мен впечатления на отговорен и компетентен колега, който преподава на високо професионално ниво, със съвременни средства и методи. Не се притеснява да въвежда новости в преподаването и поддържа високо ниво на своята квалификация като преподавател, което е оценявано не само от преподвателите в катедрата, но и от студентите. Тя е търсена от колеги за споделяне на професионален опит, на което винаги реагира позитивно. Отличната езикова подготовка на гл. ас. Петрова й дава възможност за провеждане на занятия по водените от нея курсове на английски език при необходимост, което е от голямо значение за бъдещето на извежданите от катедрата магистърски програми, както и за факултета като цяло Учебни материали Гл. ас. Петрова е участвала като съавтор или самостоятелно в изготвянето на учебни програми по следните дисциплини: в ОКС магистър - Санитарна микробиология, Биоинформационни методи в микробиологията; в ОКС бакалавър - Методи за получаване на щамове-свръхпродуценти и Микробиология с вирусология, към които е разработила лекции и упражнения. Курсът Биоинформационни методи в микробиологията е нов курс в магистърската степен, предложен и разработен изцяло от нея. Д-р Петрова е участвала в съавторство в изготвянето на шест учебни помагала на български и английски език по различни международни образователни проекти. Те са он/оф-лайн учебни помагала, включващи иновативни знания. Тези помагала са в унисон с непосредствената цел на СУ да се превърне в изследователски университет, където иновативните, смесени форми на обучение са предоставени като свободна, достъпна и акредитирана форма за кариерно развитие на широк кръг ползватели. 2

3 2.3. Работа със студенти За периода от назначаването на д-р Петрова за асистент/гл. асистент до момента под нейно научно ръководство са разработени 8 дипломни работи, което показва сериозен ежегоден ангажимент и отговорност за осигуряване на успешното им разработване и успешна защита. Практика в катедрата по Обща и промишлена микробиология е приемането на студенти за извънаудиторна изследователска работа още от първите години на обучение. Д-р Петрова винаги с готовност е поемала ангажимент за индивидуална работа с десетки студенти. 3. Изследователска дейност 3.1. Обща характеристика на научните трудове Д-р Петрова има общо 25 публикации (3 броя, от които свързани с придобиване на ОНС доктор ). За участие в настоящия конкурс са представени 22 научни труда, от които 19 са публикувани в реферирани международни и български научни списания с импакт фактор и 3 броя са публикации в сборници от международни конференции. В 73% от представените за конкурса научни публикации д-р Петрова е първи или втори съавтор. Част от публикациите на кандидата са публикувани в реномирани в научната област списания (Enzyme and Microbial Technology (ИФ 2.375), Journal of Chromatography (ИФ 2.777), Journal of Molecular Structure (ИФ 1.551), Archives of Microbiology (ИФ 1.927) и др. Представен е списък на 22 доклада, изнесени от д-р Петрова в международни и български научни форуми. Общият импакт фактор на всички трудове на кандидата е , а на тези, с които участва в конкурса h-индексът е 6. Наукометричните показатели на гл. ас. Венцислава Петрова съответстват напълно на изискванията за заемане на академичната длъжност доцент Характеристика на научната дейност на кандидата Изследователската дейност на гл. ас. Петрова стартира със зачисляването й в редовна докторантура. Тя обхваща три научни направления, взаимно-свързани помежду си обща микробиология, приложна микробиология и микробна биоинформатика, които съответстват на темата на конкурса за доцент. Изследванията по първото направление, което обхваща теоретични аспекти на клетъчната и молекулярна микробиология на еукариотни микроорганизми са обобщени в 8 научни публикации. Първото направление обхваща две поднаправления, едното от които е свързано с изследване на клетъчните и молекулярни механизми на стресов отговор при дрожди, отразени в пет от публикациите (I-12A-2-2-2, I-12A-2-2-4, I-12A-2-2-9, I-12A и I-12A-2-2-6). При тези изследвания са използвани три метаболитно различни дрождеви организми, които притежават разнообразни механизми на репарация и протекция в отговор на стресови въздействия. Отговорът към стрес е изследван в пет аспекта: (i) растеж и/или клетъчна морфология; (ii) кинетичен отговор на културата към стрес; (iii) метаболитна активност; (iv) динамика на ензимна компартментализация; (v) генни мутации и регулация. Второто поднаправление изучава връзката 3

4 между структура и функция при Cu/Zn СОД при дрожди от вида Kluyveromyces marxianus. Резултатите от тези изследвания са обобщени в три публикации (I-12A-2-2-5, I-12A I I-12A ). Второто направление на изследователската дейност на гл. ас. Петрова е в областта на приложната микробиология и изучава ферментационни процеси и получаване на биологичноактивни вещества и патентоване. В направлението се разграничават четири поднаправления. Първото от тях изучава генетичния контрол на индустриални ферментации (публикации I-12A-2-2-1, I-12A-2-2-7). Второто поднаправление е свързано с биотехнологично изследване на термотолерантни лактозоусвояващи дрожди от род Kluyveromyces продуцентни на ензими, кетокиселини, бетагалактоолигозахариди, хранителни добавки и ароматни вещества (публикации I-12A-2-2-3, I-12A и патент I-12D-1). Третото поднаправление е фокусирано върху получаването на ароматни съединения от дрожди от родовете Saccharomyces и Kluyveromyces (публикации I-12A и I-12A ), а четвъртото обхваща изследвания на гъби от род Monascus във връзка с биосинтезата от тях на пигментни препарати (патентна заявка I-12D-3). Третото научно направление в научната дейност на гл. ас. Петрова е свързано с микробната биоинформатика, включващо анализ на гени и генни клъстери, регулиращи биосинтезата на вторични метаболити и механизмите на защита при индустриален стрес. Изследванията са фокусирани в две поднаправления. Първото обхваща in silico анализ на механизмите на клетъчен отговор към индустриален стрес при гъби, резултатите от което са обобщени в шест публикации (I- 12A-2-2-9, I-12A , I-12A , I-12A , I-12A и I-12A ). Второто е фокусирано върху in silico изследване на синтезата на ароматни алкохоли (публикация I-12A ). Гл. ас. Петрова много успешно интегрира научните си изследвания от различните направления в учебния процес чрез включването им в образователни програми в магистърската степен, което се оформя като направление, свързващо изследователската с учебната дейност на кандидата. Създаден е електронен портал, който обединява иновативни научни знания и практически казуси, в създаването на които д-р Петрова участва. Тези материали са част от програми за онлайн обучение в различни научни и приложни области. В тях са въведени съвременни европейски подходи за структуриране на учебната програма. С разработените учебни помагала се цели да се подпомогне кариерното развитие на обучаващите се. Разработените учебни помагала са в научните направления на гл. ас. Петрова три от тях са свързани с проблемите на Общата микробиология и три с Приложната микробиология Характеристика и оценка на приносите Научните изследвания на д-р Петрова и резултатите от тях съдържат значими научни и научно-приложни приноси. Приемам справката на автора за приносите на неговите изследвания и ще посоча в обобщен вид по-значимите от тях както следва: 4

5 Научни приноси: Характеризиран е клетъчният растеж и динамиката на органелна биогенеза при дрожди с различен тип на метаболизъм в условия на стрес. Установено е, че дрождите с ферментативен тип метаболизъм са значително по-чувствителни към въздействие на екзогенни ксенобиотици в сравнение с тези с респираторен или окслителен тип метаболизъм. Oпределена e връзката между условията на култивиране, кинетичните параметри (µ и Y x/s ) и механизмите на стресов отговор при дрожди с раличен метаболизъм. Установена е връзката между условията на култивиране, динамиката на клетъчен растеж и регулацията на генната експресия на СОД и каталаза при дрожди с различен тип на метаболизъм. За първи път е установено, че в условията на повишена концентрация на ROS в клетките на метилотрофни дрожди от родовете Pichia и Hansenula се експресират допълнителни мултимерни форми на Mn СОД и са получени оригинални доказателства за висока термостабилност и слабата устойчивост към редуциращи агенти на СОД ензимите при тези дрожди. За първи път е доказана възможност за двойно насочване на пероксизомалната каталаза и Mn СОД при дрожди с различен тип метаболизъм в два типа органели пероксизоми и митохондрии. Постигнато е манипулиране на синтезата преимуществено на пероксизоми и митохондрии чрез управляемо култивиране на дрождите на подходяща по състав хранителна среда. Предложен е нов in situ модел за детоксикация на реактивни кислородни видове в дрождевата клетка, според който основна роля в разграждането им имат двойката ензими СОД и каталаза. За първи път е доказано, че белтъкът Ure2p при дрожди от вида S. cerevisiae има основна роля в защитата на клетката от тиол-окисляващите агенти като Н 2 О 2. Изучена е връзката между структура и функции при Cu/Zn СОД при дрожди от вида Kluyveromyces marxianus, при което е разработена процедура за получаване на пречистен ензим, изяснена е структурата му и са определени негови характеристики. Разработена е опростена процедура за оценка на генетичната стабилност на индустриални дрождеви щамове, основаваща се на мтднк-rflp анализ. Създаден е in silico модел за изследване и оценка на генетично детерминираните предимства (адаптивни стратегии) на еукариотната клетка, които дават възможност за бърз и координиран отговор на различни въздействия, свързани с оксидативния стрес. Създаден е in silico алгоритъм за охарактеризиране на щамове, продуценти на 2-фенилетанол и предвиждане на техния потенциал за индустриално приложение. 5

6 Научно-приложни приноси Селекционирани са термотолерантни лактозоусвояващи дрожди от род Kluyveromyces, продуценти на ензими, α-кетокиселини, β-галактолигозахариди, хранителни добавки и ароматни вещества, а чрез оптимизиране на условията на култивиране е постигната свръхекспресия на D-аминоксидаза, СОД, каталаза и β-галактозидаза и е разработен оригинален метод за тяхното получаване. На базата на селекция на дрожди с пробиотичен ефект е разработен метод за получаване на пробиотичен препарат с повишено съдържание на белтък, есенциални аминокиселини, витамини и омега-мастни киселини. Селекциониран е щам на вида Monascus pilosus продуцент на биомаса, пигменти и биоактивни продукти и на базата на него е разработен метод за получаване на субстанция с антибактериален и антигъбен ефект, обогатена с антиоксиданти и липиди и е направена патентна заявка. Разработени са он/оф-лайн учебни помагала, включващи иновативни научни знания и практически казуси, което е принос за иновативното развитие на системата на образованието в страната и в частност в Софийски университет. Научните трудове на гл. ас. Петрова са забелязани от международната научна общност и са получили многобройни цитирания. Трудовете й са цитирани 266 пъти, като повече от половината от тези цитирания са в реферирани издания. Цитирания са получили 82% от нейните научни трудове. 4. Проектна дейност Д-р Петрова има богата проектна дейност, която оценявам високо. Тя е участвала в 23 проекта, тематично свързани с нейната научна и преподавателска дейност. Пет от проектите са национални научни проекти, финансирани от Фонд научни изследвания към МОНМ и ИАНМСП, един е национален образователен проект по ОП «Развитие на човешките ресурси», два са вътрешноинституционални научни проекти към СУ «Св. Кл. Охридски» и 15 са международни образователни проекти по програма Leonardo da Vinci и програмата Erasmus+. На два от международните образователни проекти тя е ръководител (по един от програмата Leonardo da Vinci и Erasmus+). За сравнително неголемия трудов стаж, считам, че това е сериозна проектна ангажираност, участието в които е допринесло за нейното развитие като изследовател и преподавател. 6

7 5. Специализации Гл. ас. Венцислава Петрова е преминала през 6 специализации в европейски университети (Университет на Нант-Франция, Университет на Саарланд, Саарбрюкен-Германия, Университет на Страсбург-Франция) и научни институти (INRA, Нант- Франция) и др. Несъмнено тези специализации са допринесли за придобиване на нови занния и умения в областта на молекулярните методи за идентификация на дрожди, молекулярната биология на дрожди, влиянието на оксидативния и биологичен стрес върху клетъчния растеж, в областта на бионинформатиката и др. съвременни молекулярни методи, прилагани в анализа на патогенни микроорганизми и храни и са допринесли за нейното израстване като изследовател и преподавател. 5. Експертна и патентна дейност Д-р Петрова има издаден един патент в съавторство, както и подадени две заявки за патенти в областта на нейната научна област. Многократно тя е била рецензент на дипломни работи, разработвани в катедрата, както и търсена за консултации по въпроси от нейната научна област. 6. Организационна и административна ангажираност Д-р Петрова участва активно в редица катедрени и общофакултетни административни дейности. Тя е била секретар на катедрата, а в момента е отговорик по учебната дейност. В продължение на три години ( ) е член на КУТ към БФ, а понастоящем е отговорник по надзора и безопасността за ГМО към катедрата, член на учебната комисия към БФ и член на съвета на специалностите за Молекулярна биология към БФ. Гл. ас. Петрова е участвала в Организационния комитет на една международна конференция. 7. Награди и отличия Научната дейност на гл. ас. Петрова е оценена високо като тя е носител на няколко научни награди: награда за Най-добра научна работа на млад микробиолог от страната на Фондация Акад. Проф. Стефан Ангелов, 2004 г; грамота за научни постижения от Съюза на учените в България, 2005 г; награда за професионални и научни постижения на млад учен от СУ Св. Кл. Охридски, 2008 г. 7

8 8. Лични впечатления от кандидата Познавам д-р Петрова още от студентските години като придобила специализация в катедрата по Обща и промишлена микробиология. Впечатленията, които са се формирали в мен са за колегиален, отзивчив, трудолюбив, мотивиран млад учен и преподавател, притежаващ солидни знания в областта както на класическата микробиология, така и в нейните съвременни направления, което е особено ценно за развитието на цялата катедра. Тя е човек, който се справя с всички поети и възложени й ангажименти, доказателство за което са резултатите от нейния труд. 9. Заключение Гл. ас. д-р Венцислава Янкова Петрова има учебна заетост и научна продукция, които отговарят напълно на критериите за заемане на академичната длъжност «доцент». Дейността й в сферата на преподаването се характеризира със сериозна работа със студентите, в която се откроява нейното желание да предаде на студентите съвременни и иновативни знания в областта на общата и приложната микробиология и микробната биоинформатика. Тя е търсена от студентите като научен ръководител на дипломни работи. Нейните научни изследвания се характеризират със сериозни научни и научно-приложни приноси. Д-р Петрова е получила признание за постигнатите резултати в изследователската си дейност чрез наградите, с които е отличена, както и с многобройните цитирания на преобладаващата част от нейните научни трудове. Богатата й проектна дейност също я разкрива като много добър изследовател и като човек, който умее да работи в колектив и в същото време да ръководи такъв. Считам, че за сравнително неголемия си преподавателски и изследователски стаж в Биологически факултет д-р Петрова е работила и продължава да работи сериозно като е постигнала значителни резултати във всички академични дейности и е натрупала немалък опит. Предвид Правилника за приложение на закона за развитие на академичния състав в РБългария, Правилника за условията и реда за придобиване на научни степени и заемане на академични длъжности на СУ «Св. Кл. Охридски» и препоръките на Биологически факултет, както и въз основа на всичко посочено по-горе, убедено считам, че гл. ас. д-р Венцислава Петрова притежава всички качества и отговаря напълно на условията за заемане на академичната длъжност «доцент» по 4.3. Биологически науки (Обща и приложна микробиология и микробна биоинформатика) и бих препоръчала на уважаемите членове на научното жури, както и на Факултетния съвет на Биологически факултет да й присъдят тази длъжност единодушно год. Подпис: (проф. д-р Пенка Мончева) 8